农学院始建于1958年，1978年招收本科学生，2000年内蒙古民族大学成立，由原来的哲里木畜牧学院农学系和草原系合并组建农学院。经过60多年的建设，学院现设有农学、智慧农业两个专业（2024年1月草业科学、农业资源与环境、园林三个专业剥离成为草业学院），农学专业为国家一流本科专业建设点、国家特色专业。智慧农业专业是全国首批教育部批准的“四新”本科专业。植物生理学为国家一流课程，作物栽培学为自治区一流课程。学院有作物学硕士一级学科和农艺与种业硕士专业学位授权点。
学院现有教职工38人，兼职教师3人。其中专任教师31人，兼职博士生导师3人，硕士研究生导师13人，教授9人，副教授9人，具有博士学位教师23人。其中全国优秀教育工作者1人，全国科技助力精准扶贫工作先进个人1人，自治区教学名师2人，自治区优秀教师3人。学院现有在校本科生452人、硕士研究生85人。
学院有科尔沁沙地生态农业国家民委重点实验室、自治区饲用作物工程技术研究中心、自治区高校中（蒙）药材生态种植工程研究中心3个省部级科研平台；中央与地方共建优势特色北方农牧交错带农学学科实验室、自治区级植物生产类实践教学示范中心、自治区级研究生联合培养基地3个省部级实践教学基地；绿色生态发展研究院、大豆研究所、土壤修复利用研究中心等多个校级科学研究平台。“科技小院"4个。学院现有19个二级实验室，总面积1134.47多平方米。
学院有玉米、大豆高产栽培育种、牧草栽培、中（蒙）药材生态种植等特色鲜明的科研团队。承担国家重点研发计划、国家科技计划、国家自然科学基金等各级各类课题200余项，其中，国家级课题40项，在研经费1000余万元。科研团队中有自治区突出贡献科技人员2人，自治区“草原英才”3人，自治区新世纪“321人才工程”第一层次3人次，自治区青年拔尖人才一层次1人、自治区青年科技英才2人，10人在国家相关学会中担任常务理事或理事。“东北地区旱地耕作制度关键技术研究与应用”项目获国家科技进步二等奖，“玉米无膜浅埋滴灌节水控肥增效种植技术研究示范推广”项目获全国农牧渔业丰收一等奖和自治区科技进步一等奖，“大豆垄上三行窄沟密植技术研究与示范推广”和“内蒙古平原灌区玉米高产超高产高效栽培生理机制及技术研究与应用”项目获自治区科技进步一等奖，其他省、市级科研成果奖20余项，出版学术著作40余部，每年发表SCI、EI和核心期刊等论文50余篇，获国家发明专利授权10余项，审定作物品种8个（内民大3号大豆品种，内甜糯103、内甜糯2号鲜食玉米品种、高粮等）。玉米团队曾创造1241.09kg/亩的春玉米高产纪录、大豆团队曾创造杂交大豆制种111.7kg/亩的高产纪录。
学院教师获国家高等教育教学成果二等奖1项，获国家民委优秀教学成果一等奖1项，自治区高等教育教学成果奖一等奖3项、二等奖2项。近年毕业生考研录取率均超过50%，最高达到78.8%，涌现出了21个考研“学霸宿舍”。获“互联网+”全国大学生创新创业大赛国家银奖和自治区金奖等多个奖项。学院累计为社会培养本科学生7300余人，硕士研究生300余人。
学院坚持以立德树人为根本，以强农兴农为己任，以“新农科”建设为抓手，以培养知农爱农新型人才为目标，推动学院高质量发展。毕业生践行“中国人饭碗装中国粮”和“绿水青山就是金山银山”理念，成为新时代“下得去、留得住、干得好”的现代农林业人才，为服务地方经济社会发展和乡村振兴战略实施提供强有力的人才支撑和科技支持。