农学系始建于1980年，历经近半个世纪的发展，培养了一批知名学者、农技代表及企业家。长期以来，农学系坚持以立德树人为根本，秉承“博学明理、崇德至善”的校训，扎根北疆，以强农兴农为己任，以“新农科”建设为抓手，以培养知农爱农新型人才为目标，在人才培养、科学研究、社会服务、文化传承上取得较大的成绩。
农学系现有专任教师21人，博士研究生导师1人、硕士研究生导师10人，教授6人、副教授8人，具有博士学位教师17人，梯队教师1人荣获全国优秀教学工作者荣誉称号，1荣获自治区教学名师荣誉称号，1人荣获自治区有突出贡献专家荣誉称号，2人荣获自治区有突出贡献的中青年专家荣誉称号，2人入选自治区草原英才计划，2人入选自治区新世纪321人才工程第一层次、1人入选二层次，1人入选内蒙古自治区高校青年科技英才，2人荣获全国农学院华北片区首届青年教师教学技能大赛三等奖，6人被遴选为内蒙古民族大学科尔沁学者，4人为内蒙古民族大学青年骨干教师，6人在国家相关学会中担任理事。
农学系农学专业2000年被列为校级重点专业，2007年被遴选为自治区级品牌专业，2010年被教育部批准为国家特色专业，2019年被遴选为自治区一流专业，2021年遴选为国家级一流本科专业建设点，是我校7个国家特色专业之一。现有作物学一级学科硕士点1个，农艺与种业专业硕士点1个，其中作物栽培学与耕作学于2008年被评为自治区重点培育学科，作物学学料2019年入选国家民委重点学科。拥有国家一流课程1门，自治区一流课程1门，校级一流课程1门。
农学系教师先后获得国家优秀教学质量二等奖1项，自治区优秀教学成果一等奖3项、二等奖2项；获得国家科技进步二等奖1项，自治区科技进步一等奖3项，二等奖2项，三等奖3项，国家农牧渔业丰收计划一等奖1项，自治区农牧丰收一等奖1项，三等奖3项，通辽市科技进步一等奖4项。先后创造了1241.09kg/亩的春玉米高产纪录、杂交大豆制种111.7kg/亩的高产纪录。“玉米无膜浅埋滴灌水肥一体化技术”，2018年~2025年连续8年入选自治区农牧业主推技术，2021年和2023年入选全国农业主推技术。育成自治区审定玉米品种3个，大豆品种1个，国家登记高粱品种4个，自治区登记大麦品种2个，其中内甜糯103和内甜糯2号2个玉米品种实现转化，转化金额累计65万元。近五年，承担国家自然科学基金项目、国家重点研发计划项目、农业生物育种重大项目、内蒙古自治区“揭榜挂帅”、内蒙古自治区科技兴蒙重点专项、内蒙古自然科学基金等省部级科研项目、市校合作项目70余项。
农学系每年招收本科生约100人、硕士研究生约50人。近年来，农学系充分调动学生的积极性，参加各类比赛，学生主持的内蒙古自治区大学生创新创业项目遴选为国家级4项，省级5项；主持或参与中国大学生互联网+大赛获自治区金奖5项，校级金奖7项，银奖4项，铜奖2项。近五年，约58%学生考取中国农业大学、南京农业大学、山东农业大学、西北农林科技大学、甘肃农业大学、内蒙古农业大学、东北农业大学、宁夏大学、云南农业大学等相关院校硕士研究生；还有部分毕业生到事业单位、公务员和国企等单位就业。我系培养的毕业生品德优良、吃苦耐劳、作风踏实、热爱三农，具有较高社会认可度，形成了良好的社会声誉，为地方农业发展做出了重要贡献。